屏東縣身心障礙福利服務中心目前由財團法人平安社會福利慈善事業基金會經營管理，平安基金會係台灣基督長老教會總會為實現其宣教、教育、醫療、慈善、社會福利及其他事業等使命，於民國88年4月2日由內政部核准之全國性社會福利慈善機構。

平安基金會於101年8月1日起接受屏東縣政府委託，經營管理屏東縣身心障礙福利服務中心，12月1日承接屏東縣身心障礙者自立生活支持試辦計畫，並於107年9月起，承接屏東縣身心障礙者自立生活中心，也於109年-110年承接屏東縣推動創新且在地化婦女福利服務方案—屏障媽媽超給力應援團計畫。